六、主管稅務(wù)機關(guān)對相關(guān)信息資料進行審核分析后，認(rèn)為相關(guān)間接轉(zhuǎn)讓交易不具有合理商業(yè)目的，需要進行立案調(diào)查及調(diào)整的，應(yīng)填制《特別納稅調(diào)整立案審核表》，附立案報告及有關(guān)資料，將分析意見以及分管局領(lǐng)導(dǎo)審核意見通過特別納稅調(diào)整案件管理系統(tǒng)，層報省稅務(wù)機關(guān)復(fù)核同意后，報稅務(wù)總局申請立案。
七、主管稅務(wù)機關(guān)對相關(guān)信息資料進行審核分析后，認(rèn)為相關(guān)間接轉(zhuǎn)讓交易不涉及直接轉(zhuǎn)讓中國居民企業(yè)股權(quán)等財產(chǎn)的情況，應(yīng)形成情況分析報告，并按本規(guī)程規(guī)定將相關(guān)資料歸檔。
八、股權(quán)轉(zhuǎn)讓方通過直接轉(zhuǎn)讓同一境外企業(yè)股權(quán)導(dǎo)致間接轉(zhuǎn)讓兩項以上中國應(yīng)稅財產(chǎn)，涉及兩個以上主管稅務(wù)機關(guān)的，間接轉(zhuǎn)讓中國應(yīng)稅財產(chǎn)的交易雙方或者被間接轉(zhuǎn)讓股權(quán)的中國居民企業(yè)選擇向其中一個主管稅務(wù)機關(guān)提交《公告》第九條規(guī)定的相關(guān)資料時，該主管稅務(wù)機關(guān)負(fù)責(zé)本規(guī)程第四條、第五條、第六條和第七條規(guī)定的各項相關(guān)工作。
該主管稅務(wù)機關(guān)認(rèn)為不需要啟動立案調(diào)查及調(diào)整的，如該間接轉(zhuǎn)讓財產(chǎn)交易跨地市，應(yīng)將情況分析報告通過特別納稅調(diào)整案件管理系統(tǒng)上報省稅務(wù)機關(guān)審核；如該間接轉(zhuǎn)讓財產(chǎn)交易跨省，該主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)將情況分析報告通過特別納稅調(diào)整案件管理系統(tǒng)層報稅務(wù)總局審核。經(jīng)審核，不需要進行立案調(diào)查的，按本規(guī)程規(guī)定將相關(guān)資料歸檔。
該主管稅務(wù)機關(guān)認(rèn)為或者稅務(wù)總局、省稅務(wù)機關(guān)經(jīng)審核認(rèn)為需要進行立案調(diào)查的，稅務(wù)總局、省稅務(wù)機關(guān)可以視案情指定牽頭單位和協(xié)調(diào)單位進行聯(lián)合調(diào)查。
九、主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)在稅務(wù)總局同意立案之日起9個月內(nèi)完成案件的審理工作。形成案件不予調(diào)整或者初步調(diào)整方案的意見和理由，填制《特別納稅調(diào)整結(jié)案審核表》，附結(jié)案報告及有關(guān)資料，經(jīng)分管局領(lǐng)導(dǎo)審核后通過特別納稅調(diào)整案件管理系統(tǒng)層報省稅務(wù)機關(guān)。省稅務(wù)機關(guān)應(yīng)組成案件復(fù)核小組，對案件進行復(fù)核，復(fù)核同意后，呈報稅務(wù)總局申請結(jié)案。
對涉及的重大案件，稅務(wù)總局確定啟動重大案件會審機制的，將組成會審小組開展會審工作。會審小組由至少5名成員組成，具體人員從非居民稅收管理人才庫中指定，同時指定一名稅務(wù)總局人員組織協(xié)調(diào)會審工作。
十、主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)當(dāng)就稅務(wù)總局對其結(jié)案申請形成的審核意見，分別以下情況進行處理：
（一）對同意結(jié)案申請不予調(diào)整方案的，向被調(diào)查企業(yè)下發(fā)《特別納稅調(diào)查結(jié)論通知書》；
（二）對同意結(jié)案申請初步調(diào)整方案的，向被調(diào)查企業(yè)下發(fā)《特別納稅調(diào)查初步調(diào)整通知書》；
（三）對不同意結(jié)案申請?zhí)幚硪庖姷模凑斩悇?wù)總局的意見修改后再次層報審核。
被調(diào)查企業(yè)在收到《特別納稅調(diào)查初步調(diào)整通知書》之日起7日內(nèi)未提出異議的，主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)下發(fā)《特別納稅調(diào)查調(diào)整通知書》。
被調(diào)查企業(yè)在收到《特別納稅調(diào)查初步調(diào)整通知書》之日起7日內(nèi)提出異議，主管稅務(wù)機關(guān)經(jīng)審議后不予采納的，應(yīng)下發(fā)《特別納稅調(diào)查調(diào)整通知書》；主管稅務(wù)機關(guān)經(jīng)審議后認(rèn)為確需對調(diào)整方案進行修改的，應(yīng)將修改后的調(diào)整方案層報省稅務(wù)機關(guān)復(fù)核同意后，報稅務(wù)總局再次申請結(jié)案。
十一、主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)及時跟蹤稅款、利息、滯納金入庫情況。對于扣繳義務(wù)人或者股權(quán)轉(zhuǎn)讓方按照《公告》規(guī)定扣繳或者繳納的稅款，以及經(jīng)立結(jié)案調(diào)整的稅款，在稅款入庫后30日內(nèi)，通過特別納稅調(diào)整案件管理系統(tǒng)層報稅務(wù)總局，并將相關(guān)稅款入庫信息填入《非居民企業(yè)稅收收入情況統(tǒng)計表》。
十二、主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)在調(diào)查調(diào)整工作結(jié)束后，將工作過程中形成的文書、工作底稿、證據(jù)等材料，按相關(guān)規(guī)定集中歸檔。稅務(wù)機關(guān)內(nèi)部需要調(diào)閱的，應(yīng)嚴(yán)格執(zhí)行檔案轉(zhuǎn)出、接收和調(diào)閱手續(xù)。
各級稅務(wù)機關(guān)在調(diào)查調(diào)整工作中獲取的信息資料和調(diào)查調(diào)整情況應(yīng)按有關(guān)規(guī)定履行保密義務(wù)。
十三、主管稅務(wù)機關(guān)應(yīng)根據(jù)稅務(wù)總局結(jié)案申請審核意見，分析各案件的具體情況，總結(jié)案件的風(fēng)險點以及應(yīng)對措施，形成具體案例材料，通過可控FTP“CENTER/國際稅務(wù)司/非居民稅收管理處/間接轉(zhuǎn)讓財產(chǎn)案例”文件夾，層報稅務(wù)總局（國際稅務(wù)司）。
十四、對于《公告》實施前未辦結(jié)案件，包括已上報稅務(wù)總局，但未形成處理意見的案件，按照本規(guī)程規(guī)定的立結(jié)案流程進行處理。
十五、本規(guī)程自印發(fā)之日起執(zhí)行。
